¿Como puedo agregar nombre a un grupo de herramientas?

Sorry, that's not possible to customise

no es la solucion buena pero puedes crear harramientas falsas, es decir, que no sirvan para nada y les pones un icono con el texto que quieras y un color de fondo llamativo y las colocas al principio de cada grupo para que sirvan de marca de comienzo de grupo

Lo pude resolver agregando el nombre del grupo de herramientas desde el callback:

var element = 'ggb-element';


var callback = function(ggb) {

    const ggbElement = $(`#${element}`);
    const article = ggbElement.find('article');
    const headers = article.attr('data-param-customToolbarHeaders').split('|');
    const toolsPanel = article.find('.toolsPanel.customToolbar');
    const categoryPanels = toolsPanel.find('div:has(.categoryPanel)');

    categoryPanels.each(function (index, item) {
        const element = $(item);
        element.find('.catLabel').remove();
        element.prepend($(`<div class="catLabel" aria-hidden="true">${headers[index]}</div>`));
    });
}

var parameters = {
    "id": "ggbApplet",
    "appName": "graphing",
    "customToolbarHeaders": "Nombre para Herramientas básicas | Nombre para Edición | Nombre para Medios | Nombre para Medición | Nombre para Puntos | Nombre para Construcción | Nombre para Rectas | Nombre para Polígonos | Nombre para Circunferencias | Nombre para Cónicas | Nombre para Transformación | Nombre para Otros",
    "customToolbar": "0 1 25 , 575 76 , 58| 77 40 6 , 2827 35 | 26 17 | 36 38 49 , 4650 | 1 5 501 , 6775 76 , 7271 | 19 4 8 , 39 13 , 47| 15 2 18 , 745 37 , 4465 | 16 51 70 , 64| 10 53 24 , 3411 20 , 2221 23 | 55 12 57 , 56| 30 29 32 , 3133 54 | 62 73 14 , 6052 61 ",
    "width": window.innerWidth,
    "height": window.innerHeight,
    "showToolBar": true,
    "showAlgebraInput": true,
    "showMenuBar": false,
    "showToolBarHelp": true,
    "showZoomButtons": true,
    "allowStyleBar": true,
    "showFullscreenButton": true,
    "appletOnLoad": callback,
    "language":"es"
};

var ggbApp = new GGBApplet(parameters, true);

window.addEventListener("load", function() { 
    ggbApp.inject(element);
});